Пневмококк — основной возбудитель поражений у детей до 10лет и пожилых (65-90% всех случаев). У 30-40% населения Streptococcus pneumoniae входит в состав резидентной микрофлоры верхних дыхательных путей. Особенность возбудителя — возможность передачи от детей взрослым, у которых при наличии предрасполагающих факторов развивается пневмония. Грамотрицательные бактерии. «Классические» возбудители пневмоний у детей младше 5 лет и у пожилых старше 60 лет (4,1-15,5% всех случаев) — Н. influenzae и М. catarrhalis. До 15% случаев пневмоний у детей вызывает Е. coli.

В стационарах часто регистрируют пневмонии, вызванные К. pneumoniae, P. aeruginosa и S. marcescens. До 5-10% поражений вызывают виды Morganella, Proteus и Enterobacter. В последние годы отмечают рост количества прогрессирующих токсических пневмоний, вызываемых Legionella pneumophila (1,8-4,5% случаев пневмоний в России). До 2% поражений вызывает Chlamydia psittaci. Микоплазменные пневмонии часто возникают в форме эпидемий, возникающих с периодичностью 1 раз в 4 года. Возбудитель — Mycoplasma pneumoniae.