Выяснение механизмов функционирования биологической основы эпидемического процесса, т. е. паразитарной системы, является необходимой предпосылкой познания общих законов его возникновения, развития и прекращения. В связи с этим напомним, что И. И. Шмальгаузен еще в 1961 г. указал на всеобщность явления саморегуляции в органическом мире и продемонстрировал, что все регуляторные процессы в биологической системе осуществляются за счет сил, действующих внутри системы, и, следовательно, биологическая регуляция всегда есть саморегуляция. Им было показано также, что саморегуляция свойственна всем уровням организации живого — молекулярному, клеточному, тканево-органному, организменному, а также надорганизменным — популяционному, биоценотическому, биогеоценотическому.

В настоящее время биологические науки рассматривают всякую популяцию как сложную динамическую саморегулирующуюся систему. Основной характеристикой популяции наряду с ее генетическим единством (единым генофондом) служит генетическая гетерогенность, которая обеспечивает приспособленность популяции к меняющимся условиям среды обитания и создает резерв для эволюционной изменчивости. Этот принцип в равной мере приложим как к популяции паразита, так и к популяциям его биологических хозяев, характеризуя их взаимодействия в пределах паразитарной системы. Выражением неоднородности популяции паразитов, в частности, является вариабельность составляющих ее особей по вирулентности, иммуногенности, антигенной специфичности, устойчивости по отношению к различным физико-химическим факторам окружающей среды и др. Движущей силой изменчивости, подчиненной задачам самосохранения и самовоспроизведения популяции паразита, является приспособительная адаптация к биохимически и иммунологически неоднородной популяции биологического хозяина, а также к условиям окружающей среды. В процессе такой адаптации в популяции паразита происходит отбор тех свойств, которые необходимы ему для жизнедеятельности в популяции хозяев с данной иммунологической структурой или в определенной окружающей среде.