Случайные паразиты своеобразны в экологическом отношении. В соответствии с двумя средами обитания типичные случайные паразиты имеют две возможные, хотя и неравноценные экологические фазы — сапрофитическую (основную) и паразитическую (эпизодическую). Поскольку трансмиссивный путь циркуляции отсутствует, популяция случайного паразита может состоять из двух частей-гостальной и внеорганизменной. Характерная черта случайных паразитов — возможность автономного обитания, а иногда и накопления во внешней среде, поскольку темпы их размножения при благоприятных условиях могут заметно превышать темпы их отмирания.

В этой связи можно предположить, что внеорганизменная часть популяции имеет широкое территориальное распространение, а также высокую и относительно стабильную численность. Численность гостальной части популяции, связанная с интенсивностью эпизоотического или эпидемического процессов, хотя и способна периодически достигать очень высоких показателей, испытывает более резкие колебания, а в ряде случаев может быть весьма ограниченной. Не вдаваясь в детальное обсуждение вопросов экологии возбудителей сапронозов, отметим ключевые, активно обсуждаемые моменты.

Почвенный покров и водоемы представляют собой сложные экологические системы, включающие множество взаимосвязанных компонентов. Популяция любых микроорганизмов-сочленов экологических систем обладает определенным (часто весьма широким) диапазоном толерантности к абиотическим факторам среды (температура, влажность, рН, состав почвы и т. п.) и находятся под жестким контролем биотических факторов, включая конкуренцию, симбиоз и антибиоз микроорганизмов, воздействие микро- и мезофауны почв и водоемов.